Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB3P54284 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms