Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIRAP54198 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIRAP54198 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRAP54198 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRAP54198 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRAP54198 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRAP54198 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRAP54198 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRAP54198 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRAP54198 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRAP54198 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRAP54198 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRAP54198 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRAP54198 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRAP54198 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRAP54198 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRAP54198 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRAP54198 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRAP54198 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRAP54198 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRAP54198 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRAP54198 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIRAP54198 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIRAP54198 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIRAP54198 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIRAP54198 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIRAP54198 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIRAP54198 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRAP54198 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRAP54198 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRAP54198 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRAP54198 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRAP54198 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRAP54198 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRAP54198 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIRAP54198 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRAP54198 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRAP54198 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRAP54198 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRAP54198 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRAP54198 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIRAP54198 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms