Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRISP1P54107 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms