Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMTNP53814 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMTNP53814 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMTNP53814 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMTNP53814 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMTNP53814 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMTNP53814 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMTNP53814 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMTNP53814 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMTNP53814 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMTNP53814 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMTNP53814 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMTNP53814 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMTNP53814 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMTNP53814 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMTNP53814 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMTNP53814 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMTNP53814 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMTNP53814 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMTNP53814 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMTNP53814 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMTNP53814 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMTNP53814 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMTNP53814 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMTNP53814 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMTNP53814 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMTNP53814 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMTNP53814 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMTNP53814 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMTNP53814 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMTNP53814 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMTNP53814 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms