Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGGT1BP53609 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms