Protein–RNA interactions for Protein: P53271

COG2, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
COG2P53271 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.36□□□□□ -2.03
COG2P53271 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.36□□□□□ -2.03
COG2P53271 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.36□□□□□ -2.03
COG2P53271 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.36□□□□□ -2.03
COG2P53271 COA4YLR218C 453 nt2.36□□□□□ -2.03
COG2P53271 SNC2YOR327C 348 nt2.36□□□□□ -2.03
COG2P53271 PAC1YOR269W 1485 nt2.36□□□□□ -2.03
COG2P53271 VPS16YPL045W 2397 nt2.36□□□□□ -2.03
COG2P53271 PHO91YNR013C 2685 nt2.35□□□□□ -2.03
COG2P53271 INP51YIL002C 2841 nt2.35□□□□□ -2.03
COG2P53271 FKS3YMR306W 5358 nt2.35□□□□□ -2.03
COG2P53271 MRP10YDL045W-A 288 nt2.35□□□□□ -2.03
COG2P53271 FMP16YDR070C 282 nt2.35□□□□□ -2.03
COG2P53271 YGL069CYGL069C 465 nt2.35□□□□□ -2.03
COG2P53271 RPS29AYLR388W 171 nt2.35□□□□□ -2.03
COG2P53271 FAR11YNL127W 2862 nt2.35□□□□□ -2.03
COG2P53271 DOT6YER088C 2013 nt2.34□□□□□ -2.03
COG2P53271 snR8snR8 190 nt2.34□□□□□ -2.03
COG2P53271 GCN4YEL009C 846 nt2.34□□□□□ -2.03
COG2P53271 PHS1YJL097W 654 nt2.34□□□□□ -2.03
COG2P53271 TAR1YLR154W-C 375 nt2.34□□□□□ -2.03
COG2P53271 YMR320WYMR320W 306 nt2.34□□□□□ -2.03
COG2P53271 CBF2YGR140W 2871 nt2.33□□□□□ -2.04
COG2P53271 HMRA2YCR096C 360 nt2.33□□□□□ -2.04
COG2P53271 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.33□□□□□ -2.04
COG2P53271 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.33□□□□□ -2.04
COG2P53271 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.33□□□□□ -2.04
COG2P53271 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.33□□□□□ -2.04
COG2P53271 YGR050CYGR050C 357 nt2.33□□□□□ -2.04
COG2P53271 DNF1YER166W 4716 nt2.33□□□□□ -2.04
COG2P53271 PDR11YIL013C 4236 nt2.33□□□□□ -2.04
COG2P53271 MSB1YOR188W 3414 nt2.33□□□□□ -2.04
COG2P53271 SGS1YMR190C 4344 nt2.33□□□□□ -2.04
COG2P53271 SKP2YNL311C 2292 nt2.33□□□□□ -2.04
COG2P53271 SNU114YKL173W 3027 nt2.32□□□□□ -2.04
COG2P53271 INP53YOR109W 3324 nt2.32□□□□□ -2.04
COG2P53271 SPO22YIL073C 2928 nt2.32□□□□□ -2.04
COG2P53271 PAN3YKL025C 2040 nt2.32□□□□□ -2.04
COG2P53271 NEW1YPL226W 3591 nt2.31□□□□□ -2.04
COG2P53271 TOF1YNL273W 3717 nt2.31□□□□□ -2.04
COG2P53271 TAE2YPL009C 3117 nt2.31□□□□□ -2.04
COG2P53271 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.31□□□□□ -2.04
COG2P53271 OSH6YKR003W 1347 nt2.31□□□□□ -2.04
COG2P53271 LYS9YNR050C 1341 nt2.31□□□□□ -2.04
COG2P53271 SCD5YOR329C 2619 nt2.31□□□□□ -2.04
COG2P53271 DAD3YBR233W-A 285 nt2.3□□□□□ -2.04
COG2P53271 TMN3YER113C 2121 nt2.3□□□□□ -2.04
COG2P53271 AMS1YGL156W 3252 nt2.3□□□□□ -2.04
COG2P53271 HOS4YIL112W 3252 nt2.3□□□□□ -2.04
COG2P53271 RBK1YCR036W 1002 nt2.29□□□□□ -2.04
COG2P53271 YHL041WYHL041W 450 nt2.29□□□□□ -2.04
COG2P53271 SNC1YAL030W 354 nt2.29□□□□□ -2.04
COG2P53271 RPS27AYKL156W 249 nt2.29□□□□□ -2.04
COG2P53271 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.29□□□□□ -2.04
COG2P53271 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.29□□□□□ -2.04
COG2P53271 TOF2YKR010C 2316 nt2.29□□□□□ -2.04
COG2P53271 HSC82YMR186W 2118 nt2.29□□□□□ -2.04
COG2P53271 CSF1YLR087C 8877 nt2.28□□□□□ -2.04
COG2P53271 IRC8YJL051W 2469 nt2.28□□□□□ -2.04
COG2P53271 JIP5YPR169W 1479 nt2.28□□□□□ -2.04
COG2P53271 OST1YJL002C 1431 nt2.28□□□□□ -2.04
COG2P53271 YOL098CYOL098C 3114 nt2.28□□□□□ -2.04
COG2P53271 HTB2YBL002W 396 nt2.28□□□□□ -2.04
COG2P53271 YOP1YPR028W 543 nt2.28□□□□□ -2.04
COG2P53271 YBR224WYBR224W 516 nt2.28□□□□□ -2.04
COG2P53271 SOK2YMR016C 2358 nt2.28□□□□□ -2.05
COG2P53271 STB4YMR019W 2850 nt2.28□□□□□ -2.05
COG2P53271 YFH1YDL120W 525 nt2.27□□□□□ -2.05
COG2P53271 YGL149WYGL149W 306 nt2.27□□□□□ -2.05
COG2P53271 RPA34YJL148W 702 nt2.27□□□□□ -2.05
COG2P53271 SAR1YPL218W 573 nt2.27□□□□□ -2.05
COG2P53271 GUP1YGL084C 1683 nt2.27□□□□□ -2.05
COG2P53271 TOR1YJR066W 7413 nt2.27□□□□□ -2.05
COG2P53271 SEC16YPL085W 6588 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 YEL043WYEL043W 2871 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 HTL1YCR020W-B 237 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 PRE4YFR050C 801 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 EMC6YLL014W 327 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 AFI1YOR129C 2682 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 YDR186CYDR186C 2634 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 CDC27YBL084C 2277 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 RRP6YOR001W 2202 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 DFG16YOR030W 1860 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 YLR149CYLR149C 2193 nt2.26□□□□□ -2.05
COG2P53271 IRA2YOL081W 9240 nt2.25□□□□□ -2.05
COG2P53271 YRB1YDR002W 606 nt2.25□□□□□ -2.05
COG2P53271 YDR048CYDR048C 315 nt2.25□□□□□ -2.05
COG2P53271 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.25□□□□□ -2.05
COG2P53271 VMA9YCL005W-A 222 nt2.25□□□□□ -2.05
COG2P53271 PDR3YBL005W 2931 nt2.25□□□□□ -2.05
COG2P53271 SAP185YJL098W 3177 nt2.25□□□□□ -2.05
COG2P53271 TFC3YAL001C 3483 nt2.25□□□□□ -2.05
COG2P53271 CDC53YDL132W 2448 nt2.25□□□□□ -2.05
COG2P53271 RIC1YLR039C 3171 nt2.24□□□□□ -2.05
COG2P53271 KAP123YER110C 3342 nt2.24□□□□□ -2.05
COG2P53271 SEF1YBL066C 3447 nt2.24□□□□□ -2.05
COG2P53271 YIL059CYIL059C 366 nt2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.8 ms