Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC25A1P53007 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms