Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSEN1P49768 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms