Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTPAP49638 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTPAP49638 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTPAP49638 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TTPAP49638 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TTPAP49638 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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