Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PITPNBP48739 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms