Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ME1P48163 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME1P48163 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ME1P48163 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ME1P48163 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ME1P48163 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME1P48163 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME1P48163 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME1P48163 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME1P48163 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME1P48163 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME1P48163 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME1P48163 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME1P48163 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME1P48163 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME1P48163 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME1P48163 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME1P48163 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME1P48163 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME1P48163 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms