Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSKP43235 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSKP43235 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSKP43235 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSKP43235 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSKP43235 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSKP43235 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSKP43235 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSKP43235 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSKP43235 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSKP43235 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSKP43235 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSKP43235 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSKP43235 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSKP43235 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSKP43235 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSKP43235 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms