Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ECI1P42126 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ECI1P42126 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ECI1P42126 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ECI1P42126 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ECI1P42126 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ECI1P42126 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ECI1P42126 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ECI1P42126 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECI1P42126 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms