Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGHMBP2P38935 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms