Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 SAR1YPL218W 573 nt2.56□□□□□ -2
SSZ1P38788 LYS9YNR050C 1341 nt2.56□□□□□ -2
SSZ1P38788 CRM1YGR218W 3255 nt2.56□□□□□ -2
SSZ1P38788 MRD1YPR112C 2664 nt2.55□□□□□ -2
SSZ1P38788 YEL043WYEL043W 2871 nt2.55□□□□□ -2
SSZ1P38788 HTL1YCR020W-B 237 nt2.55□□□□□ -2
SSZ1P38788 DBP10YDL031W 2988 nt2.55□□□□□ -2
SSZ1P38788 GUP1YGL084C 1683 nt2.55□□□□□ -2
SSZ1P38788 YJL015CYJL015C 285 nt2.55□□□□□ -2
SSZ1P38788 SNC1YAL030W 354 nt2.55□□□□□ -2
SSZ1P38788 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.55□□□□□ -2
SSZ1P38788 YBR224WYBR224W 516 nt2.55□□□□□ -2
SSZ1P38788 TMN3YER113C 2121 nt2.54□□□□□ -2
SSZ1P38788 YBR184WYBR184W 1572 nt2.54□□□□□ -2
SSZ1P38788 PEX4YGR133W 552 nt2.54□□□□□ -2
SSZ1P38788 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.54□□□□□ -2
SSZ1P38788 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.54□□□□□ -2
SSZ1P38788 YOP1YPR028W 543 nt2.54□□□□□ -2
SSZ1P38788 CSF1YLR087C 8877 nt2.54□□□□□ -2
SSZ1P38788 SEF1YBL066C 3447 nt2.54□□□□□ -2
SSZ1P38788 YNL018CYNL018C 1839 nt2.54□□□□□ -2
SSZ1P38788 CBF2YGR140W 2871 nt2.53□□□□□ -2
SSZ1P38788 PAU10YDR542W 363 nt2.53□□□□□ -2
SSZ1P38788 PAU11YGL261C 363 nt2.53□□□□□ -2
SSZ1P38788 RPA34YJL148W 702 nt2.53□□□□□ -2
SSZ1P38788 EMC6YLL014W 327 nt2.53□□□□□ -2
SSZ1P38788 PAU4YLR461W 363 nt2.53□□□□□ -2
SSZ1P38788 CDC27YBL084C 2277 nt2.53□□□□□ -2
SSZ1P38788 PEP3YLR148W 2757 nt2.53□□□□□ -2
SSZ1P38788 YME2YMR302C 2553 nt2.53□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 RIM20YOR275C 1986 nt2.52□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 VPS13YLL040C 9435 nt2.52□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 PEX8YGR077C 1770 nt2.52□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 YLR149CYLR149C 2193 nt2.52□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 VPH1YOR270C 2523 nt2.52□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 MNL2YLR057W 2550 nt2.52□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 UBP15YMR304W 3693 nt2.51□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 YDR344CYDR344C 444 nt2.51□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 RPL23BYER117W 414 nt2.51□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 PRE4YFR050C 801 nt2.51□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 HHT1YBR010W 411 nt2.51□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 DAD3YBR233W-A 285 nt2.51□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 DBP6YNR038W 1890 nt2.51□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 TOF1YNL273W 3717 nt2.51□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 SPF1YEL031W 3648 nt2.51□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 SCH9YHR205W 2475 nt2.5□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.5□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.5□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.5□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.5□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.5□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.5□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.5□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.5□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.5□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.5□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 SWA2YDR320C 2007 nt2.49□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 HDA3YPR179C 1968 nt2.49□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 CYC7YEL039C 342 nt2.49□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 ERP6YGL002W 651 nt2.49□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 HOP2YGL033W 657 nt2.49□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 YGR069WYGR069W 336 nt2.49□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 YLR053CYLR053C 327 nt2.49□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 RPS12YOR369C 432 nt2.49□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 SPO22YIL073C 2928 nt2.49□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 SPG3YDR504C 384 nt2.48□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 YIL102CYIL102C 306 nt2.48□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.48□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 RPL38YLR325C 237 nt2.48□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 EFR3YMR212C 2349 nt2.48□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 CDC53YDL132W 2448 nt2.48□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 NEW1YPL226W 3591 nt2.48□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 SEC16YPL085W 6588 nt2.47□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 ARP8YOR141C 2646 nt2.47□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 STB4YMR019W 2850 nt2.47□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 GRR1YJR090C 3456 nt2.47□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 VMR1YHL035C 4779 nt2.46□□□□□ -2.01
SSZ1P38788 VPS34YLR240W 2628 nt2.46□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YDL211CYDL211C 1119 nt2.46□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YGR265WYGR265W 411 nt2.46□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.46□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 PCC1YKR095W-A 267 nt2.46□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 COS111YBR203W 2775 nt2.46□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 NPC2YDL046W 522 nt2.45□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.45□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YBL083CYBL083C 426 nt2.45□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YOR333CYOR333C 417 nt2.45□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 NUT2YPR168W 474 nt2.45□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 KRE33YNL132W 3171 nt2.45□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 IRA2YOL081W 9240 nt2.45□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.44□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 RPL42BYHR141C 321 nt2.44□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.44□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YIL032CYIL032C 357 nt2.44□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.44□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 UPS1YLR193C 528 nt2.44□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 RPL42AYNL162W 321 nt2.44□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.44□□□□□ -2.02
SSZ1P38788 FAR11YNL127W 2862 nt2.44□□□□□ -2.02
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