Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM23P36406 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms