Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 YDR286CYDR286C 345 nt3.76□□□□□ -1.81
CSE4P36012 YPR092WYPR092W 306 nt3.76□□□□□ -1.81
CSE4P36012 snR46snR46 197 nt3.76□□□□□ -1.81
CSE4P36012 SEC5YDR166C 2916 nt3.75□□□□□ -1.81
CSE4P36012 YHL005CYHL005C 393 nt3.75□□□□□ -1.81
CSE4P36012 RGM1YMR182C 636 nt3.75□□□□□ -1.81
CSE4P36012 LRE1YCL051W 1752 nt3.75□□□□□ -1.81
CSE4P36012 ILS1YBL076C 3219 nt3.75□□□□□ -1.81
CSE4P36012 CFT2YLR115W 2580 nt3.74□□□□□ -1.81
CSE4P36012 PEX8YGR077C 1770 nt3.74□□□□□ -1.81
CSE4P36012 FUN30YAL019W 3396 nt3.74□□□□□ -1.81
CSE4P36012 SNC2YOR327C 348 nt3.74□□□□□ -1.81
CSE4P36012 VMA9YCL005W-A 222 nt3.74□□□□□ -1.81
CSE4P36012 CHS2YBR038W 2892 nt3.73□□□□□ -1.81
CSE4P36012 VPS35YJL154C 2835 nt3.73□□□□□ -1.81
CSE4P36012 YDL242WYDL242W 354 nt3.73□□□□□ -1.81
CSE4P36012 VTC1YER072W 390 nt3.73□□□□□ -1.81
CSE4P36012 RPL6AYML073C 531 nt3.73□□□□□ -1.81
CSE4P36012 VPS54YDR027C 2670 nt3.73□□□□□ -1.81
CSE4P36012 snR76snR76 109 nt3.72□□□□□ -1.81
CSE4P36012 YFL065CYFL065C 309 nt3.72□□□□□ -1.81
CSE4P36012 YBR178WYBR178W 375 nt3.72□□□□□ -1.81
CSE4P36012 AI2Q0055 2565 nt3.72□□□□□ -1.81
CSE4P36012 EFR3YMR212C 2349 nt3.72□□□□□ -1.81
CSE4P36012 PTC5YOR090C 1719 nt3.72□□□□□ -1.81
CSE4P36012 YIL169CYIL169C 2988 nt3.72□□□□□ -1.81
CSE4P36012 PSY2YNL201C 2577 nt3.71□□□□□ -1.81
CSE4P36012 MYO3YKL129C 3819 nt3.71□□□□□ -1.81
CSE4P36012 SPT21YMR179W 2277 nt3.71□□□□□ -1.82
CSE4P36012 snR70snR70 164 nt3.71□□□□□ -1.82
CSE4P36012 MSB2YGR014W 3921 nt3.71□□□□□ -1.82
CSE4P36012 PLC1YPL268W 2610 nt3.71□□□□□ -1.82
CSE4P36012 STT4YLR305C 5703 nt3.71□□□□□ -1.82
CSE4P36012 snR74snR74 88 nt3.7□□□□□ -1.82
CSE4P36012 NOP53YPL146C 1368 nt3.7□□□□□ -1.82
CSE4P36012 UBP11YKR098C 2154 nt3.7□□□□□ -1.82
CSE4P36012 SMC2YFR031C 3513 nt3.7□□□□□ -1.82
CSE4P36012 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt3.69□□□□□ -1.82
CSE4P36012 VPH1YOR270C 2523 nt3.69□□□□□ -1.82
CSE4P36012 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.68□□□□□ -1.82
CSE4P36012 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt3.68□□□□□ -1.82
CSE4P36012 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt3.68□□□□□ -1.82
CSE4P36012 snR52snR52 92 nt3.68□□□□□ -1.82
CSE4P36012 GIS4YML006C 2325 nt3.67□□□□□ -1.82
CSE4P36012 DNA2YHR164C 4569 nt3.67□□□□□ -1.82
CSE4P36012 CUL3YGR003W 2235 nt3.67□□□□□ -1.82
CSE4P36012 SSQ1YLR369W 1974 nt3.67□□□□□ -1.82
CSE4P36012 FLO1YAR050W 4614 nt3.67□□□□□ -1.82
CSE4P36012 ENA5YDR038C 3276 nt3.66□□□□□ -1.82
CSE4P36012 RPS27BYHR021C 249 nt3.66□□□□□ -1.82
CSE4P36012 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.66□□□□□ -1.82
CSE4P36012 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.66□□□□□ -1.82
CSE4P36012 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.66□□□□□ -1.82
CSE4P36012 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.66□□□□□ -1.82
CSE4P36012 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.66□□□□□ -1.82
CSE4P36012 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.66□□□□□ -1.82
CSE4P36012 KRE5YOR336W 4098 nt3.66□□□□□ -1.82
CSE4P36012 KSP1YHR082C 3090 nt3.66□□□□□ -1.82
CSE4P36012 DNL4YOR005C 2835 nt3.66□□□□□ -1.82
CSE4P36012 MUK1YPL070W 1839 nt3.65□□□□□ -1.82
CSE4P36012 YBL065WYBL065W 345 nt3.65□□□□□ -1.83
CSE4P36012 YAK1YJL141C 2424 nt3.64□□□□□ -1.83
CSE4P36012 RAX2YLR084C 3663 nt3.64□□□□□ -1.83
CSE4P36012 YPL216WYPL216W 3309 nt3.64□□□□□ -1.83
CSE4P36012 PMR1YGL167C 2853 nt3.64□□□□□ -1.83
CSE4P36012 COS111YBR203W 2775 nt3.64□□□□□ -1.83
CSE4P36012 POL2YNL262W 6669 nt3.64□□□□□ -1.83
CSE4P36012 YPR089WYPR089W 2667 nt3.64□□□□□ -1.83
CSE4P36012 RRP12YPL012W 3687 nt3.64□□□□□ -1.83
CSE4P36012 SWA2YDR320C 2007 nt3.63□□□□□ -1.83
CSE4P36012 SGF11YPL047W 300 nt3.63□□□□□ -1.83
CSE4P36012 YLR149CYLR149C 2193 nt3.63□□□□□ -1.83
CSE4P36012 VPS34YLR240W 2628 nt3.63□□□□□ -1.83
CSE4P36012 DRS2YAL026C 4068 nt3.63□□□□□ -1.83
CSE4P36012 INP2YMR163C 2118 nt3.62□□□□□ -1.83
CSE4P36012 SEF1YBL066C 3447 nt3.62□□□□□ -1.83
CSE4P36012 RSN1YMR266W 2862 nt3.62□□□□□ -1.83
CSE4P36012 STU1YBL034C 4542 nt3.62□□□□□ -1.83
CSE4P36012 CSR2YPR030W 3366 nt3.62□□□□□ -1.83
CSE4P36012 HRD3YLR207W 2502 nt3.61□□□□□ -1.83
CSE4P36012 DSE4YNR067C 3354 nt3.6□□□□□ -1.83
CSE4P36012 RPL33AYPL143W 324 nt3.6□□□□□ -1.83
CSE4P36012 snR43snR43 209 nt3.6□□□□□ -1.83
CSE4P36012 GRR1YJR090C 3456 nt3.6□□□□□ -1.83
CSE4P36012 YSP2YDR326C 4317 nt3.59□□□□□ -1.83
CSE4P36012 NOP10YHR072W-A 177 nt3.59□□□□□ -1.83
CSE4P36012 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt3.59□□□□□ -1.83
CSE4P36012 PXA2YKL188C 2562 nt3.59□□□□□ -1.83
CSE4P36012 PRP6YBR055C 2700 nt3.59□□□□□ -1.83
CSE4P36012 YEL043WYEL043W 2871 nt3.59□□□□□ -1.84
CSE4P36012 YBR184WYBR184W 1572 nt3.59□□□□□ -1.84
CSE4P36012 MPT5YGL178W 2580 nt3.58□□□□□ -1.84
CSE4P36012 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.57□□□□□ -1.84
CSE4P36012 FMP16YDR070C 282 nt3.57□□□□□ -1.84
CSE4P36012 ULI1YFR026C 510 nt3.57□□□□□ -1.84
CSE4P36012 USE1YGL098W 738 nt3.57□□□□□ -1.84
CSE4P36012 TAF2YCR042C 4224 nt3.57□□□□□ -1.84
CSE4P36012 RGR1YLR071C 3249 nt3.56□□□□□ -1.84
CSE4P36012 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt3.56□□□□□ -1.84
CSE4P36012 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt3.56□□□□□ -1.84
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