Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6P35125 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6P35125 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6P35125 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6P35125 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6P35125 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6P35125 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6P35125 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6P35125 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6P35125 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6P35125 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6P35125 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6P35125 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6P35125 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6P35125 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6P35125 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
USP6P35125 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
USP6P35125 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
USP6P35125 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
USP6P35125 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
USP6P35125 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
USP6P35125 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
USP6P35125 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
USP6P35125 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
USP6P35125 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
USP6P35125 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
USP6P35125 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.58■■■□□ 2
USP6P35125 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
USP6P35125 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP6P35125 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP6P35125 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP6P35125 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP6P35125 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms