Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCM5P33992 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MCM5P33992 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCM5P33992 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCM5P33992 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCM5P33992 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCM5P33992 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCM5P33992 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCM5P33992 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms