Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P33897 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms