Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms