Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms