Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms