Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPOP30536 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPOP30536 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPOP30536 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSPOP30536 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms