Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA5P30532 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms