Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC27P30260 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC27P30260 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC27P30260 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC27P30260 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC27P30260 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC27P30260 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC27P30260 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC27P30260 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC27P30260 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC27P30260 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC27P30260 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC27P30260 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC27P30260 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC27P30260 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC27P30260 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC27P30260 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC27P30260 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC27P30260 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC27P30260 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC27P30260 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC27P30260 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC27P30260 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC27P30260 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC27P30260 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC27P30260 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC27P30260 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC27P30260 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC27P30260 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC27P30260 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC27P30260 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDC27P30260 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC27P30260 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC27P30260 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC27P30260 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC27P30260 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC27P30260 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC27P30260 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC27P30260 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC27P30260 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC27P30260 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC27P30260 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC27P30260 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms