Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCKSP29966 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCKSP29966 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCKSP29966 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCKSP29966 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCKSP29966 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCKSP29966 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCKSP29966 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCKSP29966 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms