Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD34P28906 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD34P28906 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD34P28906 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD34P28906 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD34P28906 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD34P28906 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD34P28906 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD34P28906 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD34P28906 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD34P28906 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD34P28906 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms