Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTR2AP28223 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms