Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA3P26006 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms