Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMO1P25800 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMO1P25800 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMO1P25800 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMO1P25800 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMO1P25800 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMO1P25800 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMO1P25800 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMO1P25800 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMO1P25800 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMO1P25800 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMO1P25800 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMO1P25800 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMO1P25800 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO1P25800 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO1P25800 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO1P25800 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO1P25800 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO1P25800 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMO1P25800 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMO1P25800 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMO1P25800 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms