Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NR2F2P24468 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F2P24468 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms