Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT15P19012 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT15P19012 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KRT15P19012 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT15P19012 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms