Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMPD1P17405 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPD1P17405 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms