Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms