Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CREB1P16220 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CREB1P16220 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CREB1P16220 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CREB1P16220 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CREB1P16220 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms