Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC130P13994 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC130P13994 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms