Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FCER1AP12319 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FCER1AP12319 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms