Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL6A2P12110 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms