Protein–RNA interactions for Protein: P10961

HSF1, Heat shock factor protein, yeastyeast

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSF1P10961 INP52YNL106C 3552 nt2.85□□□□□ -1.95
HSF1P10961 IKI3YLR384C 4050 nt2.84□□□□□ -1.95
HSF1P10961 snR76snR76 109 nt2.84□□□□□ -1.95
HSF1P10961 YRB1YDR002W 606 nt2.84□□□□□ -1.95
HSF1P10961 ERP6YGL002W 651 nt2.84□□□□□ -1.95
HSF1P10961 RPL6AYML073C 531 nt2.84□□□□□ -1.95
HSF1P10961 HDA3YPR179C 1968 nt2.83□□□□□ -1.96
HSF1P10961 SGD1YLR336C 2700 nt2.83□□□□□ -1.96
HSF1P10961 UPS1YLR193C 528 nt2.83□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.83□□□□□ -1.96
HSF1P10961 DFG16YOR030W 1860 nt2.83□□□□□ -1.96
HSF1P10961 BAS1YKR099W 2436 nt2.83□□□□□ -1.96
HSF1P10961 PAN3YKL025C 2040 nt2.83□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YGR250CYGR250C 2346 nt2.82□□□□□ -1.96
HSF1P10961 GUP1YGL084C 1683 nt2.82□□□□□ -1.96
HSF1P10961 SNU114YKL173W 3027 nt2.82□□□□□ -1.96
HSF1P10961 VPS35YJL154C 2835 nt2.82□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YGL052WYGL052W 306 nt2.82□□□□□ -1.96
HSF1P10961 RPS22AYJL190C 393 nt2.82□□□□□ -1.96
HSF1P10961 MSB2YGR014W 3921 nt2.82□□□□□ -1.96
HSF1P10961 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.81□□□□□ -1.96
HSF1P10961 BFA1YJR053W 1725 nt2.81□□□□□ -1.96
HSF1P10961 TOF2YKR010C 2316 nt2.81□□□□□ -1.96
HSF1P10961 UTP14YML093W 2700 nt2.81□□□□□ -1.96
HSF1P10961 DNL4YOR005C 2835 nt2.81□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YIL169CYIL169C 2988 nt2.81□□□□□ -1.96
HSF1P10961 TMN3YER113C 2121 nt2.8□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YJL150WYJL150W 303 nt2.8□□□□□ -1.96
HSF1P10961 PCC1YKR095W-A 267 nt2.8□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.8□□□□□ -1.96
HSF1P10961 NUT2YPR168W 474 nt2.8□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YBT1YLL048C 4986 nt2.8□□□□□ -1.96
HSF1P10961 TRS65YGR166W 1683 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 UBP11YKR098C 2154 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YNL028WYNL028W 318 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 FPR1YNL135C 345 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YOR015WYOR015W 360 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YOR170WYOR170W 306 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 ALK2YBL009W 2031 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 FIR1YER032W 2631 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 PTC5YOR090C 1719 nt2.79□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YPL216WYPL216W 3309 nt2.78□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YDR426CYDR426C 378 nt2.78□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.78□□□□□ -1.96
HSF1P10961 PNC1YGL037C 651 nt2.78□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.78□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YLR255CYLR255C 354 nt2.78□□□□□ -1.96
HSF1P10961 BNR1YIL159W 4128 nt2.78□□□□□ -1.96
HSF1P10961 YMR321CYMR321C 318 nt2.77□□□□□ -1.97
HSF1P10961 CSE2YNR010W 450 nt2.77□□□□□ -1.97
HSF1P10961 SNC2YOR327C 348 nt2.77□□□□□ -1.97
HSF1P10961 HRD3YLR207W 2502 nt2.77□□□□□ -1.97
HSF1P10961 KAP104YBR017C 2757 nt2.77□□□□□ -1.97
HSF1P10961 SMD1YGR074W 441 nt2.76□□□□□ -1.97
HSF1P10961 PRP8YHR165C 7242 nt2.76□□□□□ -1.97
HSF1P10961 YOR333CYOR333C 417 nt2.76□□□□□ -1.97
HSF1P10961 snR43snR43 209 nt2.76□□□□□ -1.97
HSF1P10961 ECM29YHL030W 5607 nt2.76□□□□□ -1.97
HSF1P10961 SAP1YER047C 2694 nt2.75□□□□□ -1.97
HSF1P10961 YPR089WYPR089W 2667 nt2.75□□□□□ -1.97
HSF1P10961 RRP12YPL012W 3687 nt2.75□□□□□ -1.97
HSF1P10961 KSP1YHR082C 3090 nt2.75□□□□□ -1.97
HSF1P10961 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.75□□□□□ -1.97
HSF1P10961 YBR224WYBR224W 516 nt2.75□□□□□ -1.97
HSF1P10961 VMA9YCL005W-A 222 nt2.75□□□□□ -1.97
HSF1P10961 PRP6YBR055C 2700 nt2.75□□□□□ -1.97
HSF1P10961 MMS1YPR164W 4224 nt2.75□□□□□ -1.97
HSF1P10961 LCD1YDR499W 2244 nt2.74□□□□□ -1.97
HSF1P10961 DNA2YHR164C 4569 nt2.74□□□□□ -1.97
HSF1P10961 BUD4YJR092W 4344 nt2.74□□□□□ -1.97
HSF1P10961 TRX1YLR043C 312 nt2.74□□□□□ -1.97
HSF1P10961 RPL33AYPL143W 324 nt2.74□□□□□ -1.97
HSF1P10961 PEX8YGR077C 1770 nt2.74□□□□□ -1.97
HSF1P10961 HSC82YMR186W 2118 nt2.74□□□□□ -1.97
HSF1P10961 VIK1YPL253C 1944 nt2.74□□□□□ -1.97
HSF1P10961 NOP10YHR072W-A 177 nt2.73□□□□□ -1.97
HSF1P10961 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.73□□□□□ -1.97
HSF1P10961 VPS55YJR044C 423 nt2.73□□□□□ -1.97
HSF1P10961 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.73□□□□□ -1.97
HSF1P10961 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.73□□□□□ -1.97
HSF1P10961 PRP39YML046W 1890 nt2.73□□□□□ -1.97
HSF1P10961 SSS1YDR086C 243 nt2.72□□□□□ -1.97
HSF1P10961 INA22YIR024C 651 nt2.72□□□□□ -1.97
HSF1P10961 YNL170WYNL170W 396 nt2.72□□□□□ -1.97
HSF1P10961 CRS5YOR031W 210 nt2.72□□□□□ -1.97
HSF1P10961 NOP53YPL146C 1368 nt2.72□□□□□ -1.97
HSF1P10961 YPL150WYPL150W 2706 nt2.71□□□□□ -1.98
HSF1P10961 YEL014CYEL014C 306 nt2.71□□□□□ -1.98
HSF1P10961 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.71□□□□□ -1.98
HSF1P10961 SLH1YGR271W 5904 nt2.71□□□□□ -1.98
HSF1P10961 TOM1YDR457W 9807 nt2.71□□□□□ -1.98
HSF1P10961 JSN1YJR091C 3276 nt2.71□□□□□ -1.98
HSF1P10961 ESL2YKR096W 3588 nt2.7□□□□□ -1.98
HSF1P10961 RGA2YDR379W 3030 nt2.7□□□□□ -1.98
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