Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD28P10747 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD28P10747 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD28P10747 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD28P10747 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD28P10747 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD28P10747 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD28P10747 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms