Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRFP10586 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms