Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRGC1P0CF51 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms