Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM2P07951 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM2P07951 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM2P07951 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM2P07951 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM2P07951 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM2P07951 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM2P07951 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM2P07951 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM2P07951 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM2P07951 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM2P07951 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM2P07951 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms