Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPBP07199 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPBP07199 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPBP07199 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPBP07199 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPBP07199 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPBP07199 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPBP07199 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPBP07199 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPBP07199 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPBP07199 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPBP07199 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPBP07199 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPBP07199 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPBP07199 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPBP07199 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPBP07199 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPBP07199 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPBP07199 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPBP07199 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPBP07199 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPBP07199 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPBP07199 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPBP07199 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPBP07199 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPBP07199 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPBP07199 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPBP07199 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPBP07199 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPBP07199 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPBP07199 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPBP07199 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPBP07199 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPBP07199 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPBP07199 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPBP07199 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPBP07199 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPBP07199 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPBP07199 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CENPBP07199 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPBP07199 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPBP07199 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPBP07199 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPBP07199 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPBP07199 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPBP07199 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPBP07199 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPBP07199 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPBP07199 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPBP07199 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPBP07199 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPBP07199 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms