Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGAVP06756 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGAVP06756 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms