Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR3DP05423 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3DP05423 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms