Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB3P05106 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGB3P05106 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms