Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHG1P01857 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms