Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFRP00533 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFRP00533 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFRP00533 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFRP00533 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFRP00533 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFRP00533 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFRP00533 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EGFRP00533 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EGFRP00533 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EGFRP00533 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EGFRP00533 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EGFRP00533 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EGFRP00533 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EGFRP00533 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EGFRP00533 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EGFRP00533 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EGFRP00533 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EGFRP00533 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EGFRP00533 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EGFRP00533 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EGFRP00533 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EGFRP00533 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EGFRP00533 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EGFRP00533 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EGFRP00533 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EGFRP00533 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EGFRP00533 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EGFRP00533 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EGFRP00533 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EGFRP00533 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EGFRP00533 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EGFRP00533 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EGFRP00533 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EGFRP00533 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EGFRP00533 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EGFRP00533 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EGFRP00533 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EGFRP00533 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EGFRP00533 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EGFRP00533 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EGFRP00533 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EGFRP00533 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EGFRP00533 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EGFRP00533 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EGFRP00533 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms